تحلیل خانواده های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش طبقه ای و فراموضعی، برای شناسایی خانواده های ژنی با بیان متفاوت به عنوان عامل افتراق بین افراد سالم و بیمار (فنوتیپ) مبتلا به لنفوبلاستیک حاد که دارای کروموزوم bcr/abl هستند، استفاده شد. در این مطالعه، داده های ریزآرایه ی یک کارآزمایی بالینی لوسمی لنفوبلاستیک حاد مورد استفاده قرار گرفته و برای تحلیل داده ها از نرم افزار r استفاده گردید. یافته ها: از 200 خانواده ژنی بررسی شده، روش فراموضعی 114 خانواده را که بین جمعیت سالم و بیمار بیان متفاوتی داشتند، شناسایی کرد. در حالی که روش طبقه ای تنها موفق به شناسایی 30 خانواده ژنی با بیان متفاوت گردید.  نتیجه گیری: در هر یک از دو مجموعه خانواده های ژنی شناسایی شده به وسیله هر روش، تعدادی خانواده ی ژنی موثر در بیماری لوسمی لنفوبلاستیک حاد دیده می شود. بنابراین، اگر چه معرفی روش تحلیلی با توان تشخیصی بالاتر بین افراد سالم و بیمار مبتلا به لنفوبلاستیک حاد، نیازمند به مطالعه ای دقیق تر است، اما بررسی خانواده های ژنی مشترک بین دو روش منجر گردید، آخرین یافته های بیولوژیست ها تنها با استفاده از این روش های آماری به دست آید.